主な違い - ゲノミクスとプロテオミクス
ゲノミクス、プロテオミクス、およびメタボロミクスは、生物のゲノム、遺伝的指示に基づいて合成されたタンパク質産物、およびそれぞれ代謝する分子の種類。ゲノミクスとプロテオミクスは密接に関連する分野です。 主な違い ゲノミクスとプロテオミクスの間にあるのは、ゲノミクスは細胞のゲノム内の遺伝子セット全体の研究であるのに対し、プロテオミクスは細胞によって生成されるタンパク質セット全体の研究です。 .一方、メタボロミクスは、細胞の酵素反応の基質および副産物として機能する低分子量化合物全体の研究です。
対象となる主な分野
1.ゲノミクスとは
– 定義、技法、分類
2.プロテオミクスとは
– 定義、技法、分類
3.ゲノミクスとプロテオミクスの類似点は何ですか
– 共通機能の概要
4.ゲノミクスとプロテオミクスの違いは何ですか
– 主な相違点の比較
重要な用語:遺伝子、ゲノミクス、ヒトゲノム プロジェクト (HGP)、ヒト プロテオーム プロジェクト (HPP)、タンパク質、プロテオーム、プロテオミクス
ゲノミクスとは
ゲノミクスとは、ゲノム内の遺伝子セット全体の研究を指します。ゲノムは、生物の遺伝情報の完全なセットであり、主に DNA で構成されています。ゲノミクスでは、ハイスループット技術を使用して、ゲノムのマッピング、配列決定、および分析を行います。ゲノミクスに関連する技術には、遺伝子配列決定、全ゲノムショットガン配列決定、発現配列タグ (EST) の構築、一塩基多型 (SNP) の同定、およびさまざまなソフトウェアを使用した配列決定されたデータの分析と解釈などの遺伝子配列決定戦略が含まれます。データベース。ショットガン シーケンスの主な手順を 図 1 に示します。
図 1:環境ショットガン シーケンス (ESS)
サンプリング、(B) 粒子のフィルタリング、(C) DNA の抽出と溶解、(D) クローニングとライブラリ、(D) シーケンス、(E) シーケンスのアセンブリ
ゲノミクスの 2 つの主な領域は、構造ゲノミクスと機能ゲノミクスです。 構造ゲノミクス 、機能ゲノミクスでは、遺伝子の構造と相対位置が研究されます 、代謝活動の調節における遺伝子の機能または役割が研究されています。ゲノム配列決定プロジェクトは、ゲノミクスにおける最新の開発です。ヒトゲノム プロジェクト (HGP) は 2003 年に完了しました。ヒトゲノム プロジェクトの目標は次のとおりです。
- 宛先 識別する ヒトゲノムのすべての (約 20,000-25,000) 遺伝子
- 決定する ヒトゲノムを構成する配列全体 (約 30 億の化学塩基対)、
- 保存する データベース内のこの情報
- 改善する データ分析ツール
- 転送する 民間部門への関連技術
- 宛先 プロジェクトから生じる可能性のある倫理的、法的、社会的問題 (ELSI)。
ヒトゲノムに加えて、マウスとイネのゲノムもゲノム研究の対象となっています。
プロテオミクスとは
プロテオミクスとは、細胞によって生成されるタンパク質のセット全体の研究を指します。プロテオームは、細胞によって生成されるタンパク質の完全なセットです。プロテオミクスでは、タンパク質の 3D 構造と機能のキャラクタリゼーションが、ハイスループット手法を使用して実行されます。プロテオミクスに関連する技術には、タンパク質の抽出と電気泳動による分離、トリプシンを使用した小さな断片へのタンパク質の消化、質量分析によるアミノ酸配列の決定、およびタンパク質データベースの情報を使用したタンパク質の同定が含まれます。さらに、タンパク質の 3 D 構造は、ソフトウェア ベースの方法を使用して予測できます。タンパク質の発現は、タンパク質マイクロ アレイによって調べることができます。タンパク質ネットワーク マップは、タンパク質間相互作用を決定するために開発できます。プロテオミクスのさまざまな現象を 図 2 に示します。
図 2:プロテオミクス
ヒトゲノムの遺伝子のタンパク質産物は、ヒトプロテオームプロジェクト (HPP) で研究されています。ヒト プロテオーム プロジェクトの主な目的の 1 つは、主要な疾患に関与するタンパク質を特定することです。
ゲノミクスとプロテオミクスの類似点
- ゲノミクスとプロテオミクスは、生物の研究で使用される 2 つの密接に関連した科学分野です。
- ハイスループット技術は、ゲノミクスとプロテオミクスの両方で使用されます。
ゲノミクスとプロテオミクスの違い
定義
ゲノミクス: ゲノミクスとは、ゲノム内の遺伝子セット全体の研究を指します。
プロテオミクス: プロテオミクスとは、細胞によって産生される一連のタンパク質全体の研究を指します。
現象
ゲノミクス: ゲノミクスには、ゲノムのマッピング、配列決定、および分析が含まれます。
プロテオミクス: プロテオミクスには、タンパク質の 3D 構造と機能、およびタンパク質間相互作用が含まれます。
分類
ゲノミクス: ゲノミクスには、構造ゲノミクスと機能ゲノミクスの 2 種類があります。
プロテオミクス: 3 種類のプロテオミクスは、構造、機能、および発現プロテオミクスです。
重要な分野
ゲノミクス: ヒトゲノム プロジェクトなどのゲノム配列決定プロジェクトは、ゲノミクスの重要な分野です。
プロテオミクス: SWISS-2DPAGE などのプロテオーム データベースの開発とコンピューター支援による創薬のためのソフトウェア開発は、プロテオミクスの重要な分野です。
結論
ゲノミクスとプロテオミクスは、生物の研究で使用される 2 つの科学分野です。ゲノミクスは生物の遺伝子セット全体の研究であり、プロテオミクスは細胞によって生成されるタンパク質セット全体の研究です。ゲノミクスとプロテオミクスの主な違いは、生物研究における各分野の基準です。
参照:
1.グリフィス、アンソニーJF。 「ゲノミクス：概要。」遺伝子解析入門。第 7 版、米国国立医学図書館、1970 年 1 月 1 日、こちらから入手可能。
2.無限。 「ゲノミクスとプロテオミクス」ゲノミクスとプロテオミクス |
3. 無限の生物学、こちらから入手できます。 Graves、Paul R.、Timothy A. J. Haystead。 「分子生物学者のためのプロテオミクスガイド」。 Microbiology and Molecular Biology Reviews、American Society for Microbiology、2002 年 3 月、こちらから入手可能。
画像提供:
1.「環境ショットガン配列決定」John C. Wooley、Adam Godzik、Iddo Friedberg 著 - (CC BY 2.5) コモンズ ウィキメディア経由
2.英語版ウィキブックスの Xxl7441 による「プロテオミクス」 – en.wikibooks からコモンズに移管。 (パブリック ドメイン) コモンズ ウィキメディア経由
