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RAPDとRFLPの違い

主な違い RAPD と RFLP の違いは、RAPD は、短いプライマーを使用して大きなテンプレート内の DNA のランダムなフラグメントを増幅するタイプの PCR であるのに対し、RFLP では、1 つまたは複数の制限酵素が DNA サンプルを消化し、制限フラグメントを生成してから、ゲル電気泳動。 したがって、RADP はアッセイに少量の DNA しか必要としませんが、RFLP は大量の DNA を必要とします。さらに、RAPD は 1 ~ 10 の遺伝子座を検出できる迅速なプロセスですが、RFLP は 1 ~ 3 の遺伝子座しか検出できない低速のプロセスです。さらに、RAPD は対立遺伝子バリアントを検出できませんが、RFLP は対立遺伝子バリアントを検出できます。

RAPD(ランダム増幅多型 DNA)と RFLP(制限断片長多型)は、相同 DNA のバリエーションを利用して、短い DNA 配列である遺伝子マーカーを検出する分子生物学の 2 つの手法です。

対象となる主な分野

1. RAPD とは
– 定義、手順、重要性
2. RFLP とは
– 定義、手順、重要性
3. RAPD と RFLP の類似点
– 共通機能の概要
4. RAPD と RFLP の違いは何ですか
– 主な相違点の比較

主な用語

遺伝子マーカー、PCR、RAPD、制限消化、RFLP

RAPDとは

RAPD またはランダムに増幅された多形 DNA は、DNA 変異を検出するための高速な PCR ベースの方法です。 2 つの研究室 (Williams et. al., 1990; Welsh and McClelland, 1990) が独自にこの技術を開発しました。さらに、RAPD は、多くの個別の DNA 産物の増幅に単一の任意のプライマーを使用します。 RAPD に含まれる手順は次のとおりです。

<オール>
  • DNA抽出
  • ランダムプライマーによる増幅
  • ゲル電気泳動とマーカーの可視化

    図 1:RAPD マーカーによるレタスの多様性

  • さらに、得られたパターンを解決することにより、特定の DNA サンプルの半固有の DNA プロファイルを生成できます。アッセイで使用されるランダムプライマーの特異性が低いため、ランダムプライマーごとに比較的多数の遺伝子座を増幅できます。ただし、RAPD は、遺伝子マッピング、集団遺伝学、分子進化遺伝学、動植物育種などにとって重要な手法です。さらに、速度、コスト、効率、および生成されるマーカーの数の点で、初心者にとって重要です。

    RFLPとは

    RFLP または制限長多型は、相同 DNA のバリエーションを利用する方法です。識別力の高い方法としても知られています。ただし、RFLP は非 PCR ベースの方法であるため、ゲノムのフラグメントの生成に制限酵素を使用します。さらに、RFLP は個人間の制限断片の長さの違いを検出します。 RFLP に含まれる 3 つのステップは次のとおりです。

    <オール>
  • DNAの制限消化
  • ゲル電気泳動
  • 特定のプローブと検出によるサザンブロッティング

    図 2:RFLP による対立遺伝子バリアントの検出

  • さらに、このプロセスで使用される制限酵素は、特定の DNA 配列に固有のものです。制限酵素の認識配列が短いほど、より多くの断片を生成することができます。さらに、RFLP は、ジェノタイピング、法医学、父子鑑定、遺伝性疾患のパターンの検出、および疾患キャリアの検出において重要です。しかし、それは大量の DNA を必要とする、労働集約的で時間のかかるプロセスです。

    RAPD と RFLP の類似点

    • RAPD と RFLP は、分子レベルでの 2 つの技術です。相同DNAの変異を利用する遺伝子マーカーを検出する生物学。
    • 遺伝子マッピングに必要な DNA 多型を検出します、ゲノムフィンガープリンティング、および遺伝的関連性の調査に使用されます。
    • したがって、個人を区別するのに役立ちます。種または集団。
    • さらに、どちらの方法も合計金額を使用します分析のためのゲノムの DNA の。

    RAPD と RFLP の違い

    定義

    RAPD(ランダム増幅多型 DNA)は、遺伝的変異を特定するための PCR ベースの技術を指し、RFLP(制限断片長多型)は遺伝分析の分子的手法を指します。 DNAの特定の領域を切断する制限酵素のユニークなパターンに基づいて識別されます。

    方法の種類

    さらに、RAPD は PCR ベースの方法ですが、RFLP は非 PCR ベースの方法です。

    方法

    RAPD は、ランダム プライマーを使用したゲノム内の遺伝子マーカーの増幅を伴いますが、RFLP は、ゲノム DNA の制限消化を伴います。

    DNA量

    さらに、RAPD では分析に少量の DNA (10 ~ 50 ng) が必要ですが、RFLP では比較的大量の DNA (2 ~ 10 μg) が必要です。

    種の特異性

    RAPD はあらゆる種に共通のランダム プライマーを使用しますが、RFLP は異なる種特異的なプローブを使用します。

    効率

    さらに、RAPD はステップ数が少なく迅速なプロセスですが、RFLP はプロセスが遅いためステップ数が多くなります。

    信頼性

    RAPD の信頼性は低く、RFLP の信頼性は高くなります。

    検出能力

    RAPD と RFLP のもう 1 つの違いは、RAPD は 1 ~ 10 の遺伝子座を検出できるのに対し、RFLP は 1 ~ 3 の遺伝子座しか検出できないことです。

    対立遺伝子バリアントの検出

    さらに、RAPD は対立遺伝子変異体を検出できませんが、RFLP は対立遺伝子変異体を検出できます。

    重要性

    RAPD は、遺伝子マッピング、集団遺伝学、分子進化遺伝学、動植物の育種などに重要な技術です。一方、RFLP は、ジェノタイピング、法医学、父子鑑定、遺伝子の検出に重要です。遺伝性疾患のパターン、および疾患キャリアの検出。

    結論

    RAPD は、ゲノムに存在する遺伝子マーカーを検出する PCR ベースの技術です。さらに、これらのマーカーの増幅にはランダムプライマーを使用します。 RAPD は PCR ベースの手法であるため、少量の DNA しか必要としません。さらに、迅速な方法ですが、対立遺伝子バリアントを検出することはできません。対照的に、RFLP は、ゲノム内の DNA 変異を検出する非 PCR ベースの方法です。ただし、DNA の制限消化、サザンブロッティング、および特定のプローブを使用した配列の検出を使用します。したがって、より信頼性の高い方法です。しかし、それには大量の DNA が必要です。したがって、RAPD と RFLP の主な違いは手順と重要性です。

    参考文献:

    1.「ランダム増幅多型DNA(RAPD)」。
    2. 国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
    2. 「制限断片長多型(RFLP)」。国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館、こちらから入手可能。

    画像提供:

    1. Llull~commonswiki による「RAPD」を想定 – Commons Wikimedia を介して自分の作品を想定 (パブリック ドメイン)
    2. 「RFLP フィギュア」Kenneth.jh.han 著 – Commons Wikimedia による自身の作品(CC BY-SA 3.0)


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