著者：
*ジョン・スミス
*ジェーン・ドー
*マイケルジョーンズ
所属：
*カリフォルニア大学デイビス校植物生物学部
*アリゾナ大学生態学および進化生物学部
要約：
侵略的な植物は、世界中の自然の生態系に対する大きな脅威です。彼らは、水や日光などの資源のために在来植物を微分することができ、地域の土壌化学と水文学を変えることもできます。これは、在来植物のコミュニティとそれらに依存する動物に壊滅的な影響を与える可能性があります。
侵略的な植物が成功することを可能にする重要な要因の1つは、新しい環境に適応する能力です。これは多くの場合、遺伝子発現の変化が原因であり、成長率、葉のサイズ、根構造などの植物特性の変化につながる可能性があります。
侵略的な植物が新しい環境にどのように適応するかを理解するには、それらのトランスクリプトームを詳細に理解する必要があります。トランスクリプトームは、細胞によって生成されるすべてのRNA分子の収集です。トランスクリプトームを研究することにより、発現している遺伝子と、異なる環境条件に応答してその発現がどのように変化するかを特定できます。
この研究では、有害な雑草のトランスクリプトーム、_centaurea maculosa_を組み立てました。 _C。 Maculosa_は、北米で侵襲的になったヨーロッパとアジアのネイティブです。これは、米国西部の在来植物コミュニティにとって大きな脅威であり、他の植物を除外する密な林分を形成することができます。
RNA-seqとde novoアセンブリの組み合わせを使用して、_cの高品質のトランスクリプトームアセンブリを生成しました。 maculosa_。アセンブリには100,000を超える転写産物が含まれており、植物によって発現される遺伝子の大部分を表しています。
また、_Cの間に示差的に発現する遺伝子を特定するために、微分遺伝子発現分析を実行しました。さまざまな環境で栽培されたマクロサ_植物。多くの遺伝子が、一般的な庭で栽培された植物と、フィールド環境で栽培された植物の間で差別的に発現していることがわかりました。これらの遺伝子は、さまざまな環境条件に対する植物の反応に関与する可能性があります。
この研究で生成したトランスクリプトームアセンブリと微分遺伝子発現解析は、_Cを研究するための貴重な新しいリソースを提供します。 Maculosa_および他の侵襲的植物は新しい環境に適応します。これらのリソースは、侵略的な植物が成功し、それらの広がりを制御するための新しい戦略を開発できるメカニズムを理解するのに役立ちます。
キーワード：
*トランスクリプトームアセンブリ
*遺伝子発現
*侵入植物
* _CENTAUREA MACULOSA_
