1.不完全または誤ったラベルの参照データベース：DNAバーコードの精度は、参照シーケンスの包括性と正しい識別に大きく依存しています。参照データベースが不完全であるか、誤ったラベル付けされたシーケンスを含んでいる場合、容易に識別される可能性があります。これは、データベースに表されない可能性のある新たに発見された、または研究不良の種にとって特に困難です。
2.種内変動：DNAバーコードの精度は、種間の種内の遺伝的変異（種間変動）が種間の遺伝的分岐（種間変動）と比較して低いことを前提としています。ただし、特定の場合、種内変動が高く、種のDNAバーコードシーケンス間の重複につながる可能性があります。これにより、密接に関連する種と不可解な種を区別することが困難になります。
3。ハイブリッド個体：ハイブリダイゼーション、異なる種の交配は、遺伝的背景が混在する個人をもたらす可能性があります。ハイブリッド個体からのDNAバーコードの分析は、中間またはモザイクパターンを示す可能性があるため、困難な場合があります。
4。古代または劣化したDNA：古代または劣化したDNAサンプルを使用すると、得られたDNAの品質と量が損なわれる可能性があります。劣化したDNAには、種の同定に影響を与える可能性のある配列が欠落または損傷した可能性があるため、これはDNAバーコードの精度に影響を与える可能性があります。
5。環境汚染：環境DNA（EDNA）サンプリングには、土壌、水、空気などの環境源から遺伝物質を収集することが含まれます。ただし、EDNAサンプルは非標的生物からの汚染に対して脆弱であり、誤検知または誤った種の識別につながります。
6.ミトコンドリアの遺伝子移入：特定の場合、ミトコンドリアDNA（DNAバーコードによく使用されることが多い）は、ハイブリダイゼーションまたは他の進化プロセスを通じて種間で転送できます。この現象は、ミトコンドリアの遺伝子移入として知られており、種の進化の歴史とDNAバーコード配列との間に不一致をもたらし、誤った種の同定につながる可能性があります。
DNAバーコードの結果を解釈する際に、エラーの制限と潜在的なエラー源を認識することが重要です。研究者は、特に挑戦的または不確実な症例に対処する場合に、DNAバーコードの識別を裏付け、検証するために、形態学的分析、生態学的データ、核DNA配列などの追加の証拠を使用することがよくあります。
