1。 DNA曲げ： タンパク質は、DNA二重らせんに曲がりを誘発し、隠されたDNA配列を露出させる可能性があります。これは、特定のDNA配列に結合し、DNA構造の立体構造変化を誘導するタンパク質、またはDNA骨格に結合し、配列特異性なしにDNAの曲がりを誘発するタンパク質によって達成できます。
2。 DNAループ： タンパク質は、DNAをループすることにより、遠いDNA配列を近接にすることができます。これは、2つの異なるDNA配列に結合してそれらをまとめるタンパク質、または単一のDNA配列に結合してDNAにループを誘導するタンパク質によって達成できます。
3。 DNA融解： タンパク質は、DNA二重らせんを溶かすことができ、隠されたDNA配列を露出させることができます。これは、特定のDNA配列に結合し、DNA塩基ペア間の水素結合を破壊するタンパク質、またはDNA骨格に結合し、融解につながるDNA構造の立体構造変化を誘導するタンパク質によって達成できます。
4。 DNA巻き戻し： タンパク質はDNA二重らせんを解き放ち、隠されたDNA配列を露出させることができます。これは、特定のDNA配列に結合し、DNAを配列固有の方法で巻き戻すタンパク質、またはDNA骨格に結合し、巻き戻しにつながるDNA構造の立体構造変化を誘導するタンパク質によって達成できます。
5。その他のメカニズム： これらのメカニズムに加えて、タンパク質は、DNA塩基ペア間の挿入、DNA修飾に結合すること、またはDNAに結合した他のタンパク質との相互作用など、他のメカニズムによって隠されたDNA配列に結合することもできます。
タンパク質が隠されたDNAに結合する特定のメカニズムは、タンパク質の構造と機能、ならびにDNA配列と構造に依存します。
