RNA分子は遺伝子発現に不可欠であり、DNAから細胞のタンパク質作成機械に遺伝情報を運ぶメッセンジャーとして作用します。ただし、一部のRNA分子は非常に短命で、数秒または数分間存在しているため、勉強するのが困難です。
Slam-seqと呼ばれる新しい手法(MATE-PAIRシーケンスによる短命のRNA分析のため)は、化学標識とハイスループットシーケンスの組み合わせを使用して短命のRNA分子をキャプチャして特定することにより、この課題を克服します。
Slam-seqを使用して、研究者はヒト細胞の数千の短命のRNA分子を特定し、その発現パターンを分析することができました。彼らは、これらの短命のRNAが、細胞の成長、分化、アポトーシスを含むさまざまな細胞プロセスに関与していることを発見しました。
研究者はまた、短命のRNAの発現が、DNAをRNAに転写する酵素であるRNAポリメラーゼIIの活性と密接に調整されていることを発見しました。これは、短命のRNAが遺伝子転写の調節に重要な役割を果たすことを示唆しています。
この新しい手法は、細胞プロセスにおける短命のRNAの役割を研究するための強力なツールを提供し、RNA代謝の破壊によって引き起こされる病気の新しい治療法の開発につながる可能性があります。
この研究は、Nature誌に掲載されています。