1。末端反転繰り返し（TIR）：DNAトランスポゾンなどの多くの転位可能な要素には、端に末端反転繰り返し（TIR）があります。 TIRは、トランスポサゼ酵素によって特異的に結合された認識シーケンスとして機能します。トランスポザゼは、TIRを認識して結合し、転移性要素の宿主ゲノムへの統合を促進することができます。
2。ターゲットサイトの重複（TSD）：レトロトランスポゾンなどの一部のトランスポゾンは、統合時にターゲットサイトの複製（TSD）を生成します。 TSDは、挿入された転置可能な要素に隣接する短い直接的な繰り返しです。レトロトランスポジションに関与するトランスポサゼは、効率的な統合を可能にする特定のDNA配列モチーフまたは構造的特徴を持つ領域に転置可能な要素を認識して挿入できます。
3。相同性監督修復（HDR）：特定のモバイルDNAシーケンス、特に系統として知られるレトロトランスポゾン（長い核核元素）は、相同性指向修復（HDR）メカニズムを利用して標的部位を見つけることができます。 HDRは、配列相同性に基づいて、DNA配列を宿主ゲノムの特定の領域に正確に統合することを可能にします。ラインは、HDRのテンプレートとして、他のゲノム領域からの独自の内部シーケンスまたはシーケンスを使用して、ターゲット挿入を可能にします。
4。ターゲットプライミング：Sines（短い散在する核元素）などのレトロトランスポゾンは、挿入にターゲットプライミングと呼ばれるプロセスを使用します。標的プライミングには、TRNA遺伝子や他のサイン要素などの特定の配列のために宿主ゲノムをスキャンするレトロトランスポゾンの逆転写酵素酵素が含まれます。次に、逆転写酵素はこれらの配列をプライマーとして使用して、転置可能な要素の逆転写を開始し、プライミングされた位置への統合につながります。
5。クロマチンのアクセシビリティ：クロマチン領域のアクセシビリティは、モバイルDNA配列のターゲティングにも影響します。トランスポサゼ酵素は、DNAが密着していないオープンまたはアクセス可能なクロマチン領域に統合するための好みを示すことができます。これにより、より効率的な挿入と宿主ゲノムへの転置可能な要素の統合が可能になります。
モバイルDNAシーケンスのターゲティングメカニズムは複雑であり、転位要素のクラスやファミリーによって異なる場合があることに注意することが重要です。特定のターゲティングの好みとメカニズムは、時間の経過とともに進化する可能性があり、宿主ゲノム内の転置可能な要素挿入の多様性とダイナミクスに貢献します。
