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有害な雑草のトランスクリプトームを組み立てる:植物がどのように侵入するかを研究するための新しいリソース

タイトル: 有害な雑草のトランスクリプトームを組み立てる:植物がどのように侵入するかを研究するための新しいリソース

要約:

*侵入植物*は、生態系、農業、および人間の健康に迅速かつ悪影響を与える非ネイティブ種です。その成功の根底にある分子メカニズムを理解することは、効果的な管理戦略を開発するために重要です。 * Ambrosia artemisiifolia*(一般的なラグウィード)は、世界の多くの地域に侵入した北米原産の有害な雑草であり、経済と健康の重大な負担を引き起こしています。ここでは、 *aの *de novo *アセンブリを報告します。 Illuminaショートリードシーケンスを使用したArtemisiifolia*トランスクリプトーム。私たちのアセンブリは、100,000を超える転写産物と97.1%のBusco完全性スコアを備えた高品質のトランスクリプトームを生成しました。さまざまなデータベースを使用してトランスクリプトームに注釈を付け、光合成、ストレス反応、生殖などの主要な生物学的プロセスに関与する遺伝子の推定オーソログを特定しました。私たちのトランスクリプトームデータは、分子生態学、進化、および *aの管理に関するさらなる研究のための貴重なリソースを提供します。 Artemisiifolia*およびその他の侵襲的植物。

キーワード: *Ambrosia artemisiifolia*、トランスクリプトームアセンブリ、遺伝子発現、浸潤植物、分子生態学

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