ウイルス: ウイルスは、異なる生物間でDNAを移すことができる天然ベクターです。バクテリオファージなどの一部のウイルスは、細菌に感染し、独自のDNAを細菌ゲノムに挿入することができます。レトロウイルスなどの他のウイルスは、真核細胞のゲノムにDNAを挿入できます。
プラスミド: プラスミドは、染色体DNAとは独立して複製できる小型の円形DNA分子です。プラスミドは、外来DNAを運ぶように設計でき、共役と呼ばれるプロセスを通じて細菌間で移動することができます。
cosmids: COSMIDは、プラスミドよりも大きなDNAフラグメントを運ぶことができる大きなプラスミドです。 Cosmidsを使用して、サイズが最大40キロ塩基のDNAフラグメントをクローンすることができます。
細菌人工染色体(BACS): BACは、サイズが最大300キロバーゼまでのDNAフラグメントを運ぶことができる大きい円形のDNA分子です。 BACは、プラスミドや宇宙ではクローン化できない大きなDNAフラグメントをクローンするために使用されます。
酵母人工染色体(YACS): YACは、DNAフラグメントを最大1メガベースのサイズまで運ぶことができる、大きくて円形のDNA分子です。 YACは、BACでクローン化できない非常に大きなDNAフラグメントをクローンするために使用されます。