発酵は、細胞呼吸中には発生しません。むしろ、発酵は細胞呼吸の代替プロセスであり、細胞呼吸を実行するのに利用可能な酸素が不十分な場合に発生します。発酵中、グルコースは酸素を使用せずに小さな分子に分解され、少量のATPが生成されます。