その理由は次のとおりです。
* 疎水性: TRPは高度に疎水性のアミノ酸であり、水を撃退することを意味します。 タンパク質のコア内に埋葬される可能性が高く、水性環境から離れています。
* 極性: GLNは極性であり、水分子と水素結合を形成できます。これにより、タンパク質表面の親水性環境とより互換性があります。
* サイズ: TRPは、かさばる側鎖を備えた大型アミノ酸であり、表面への曝露には適していません。一方、GLNには、表面の相互作用に簡単に対応できる小さなサイドチェーンがあります。
例外:
GLNは一般にTRPよりも表面に露出していますが、例外があります。
* 特定のタンパク質構造: 一部のタンパク質には、表面にTRPの存在を必要とする特定の構造要件がある場合があります。
* 機能的役割: TRP残基は時々タンパク質機能に関与する可能性があるため、タンパク質間相互作用や結合部位など、表面に見られる可能性があります。
要約:
一般的な経験則では、TRPはタンパク質の内部に埋葬される可能性が高いということですが、GLNは親水性とサイズが小さいために表面に見られる可能性が高いということです。ただし、特定のタンパク質とその機能要件に応じて、この規則には例外があります。