* 高解像度： SEMは非常に高解像度の画像を提供し、ナノメートルスケールまで、表面の特徴を非常に詳細に見ることができます。これは、細胞と生物の複雑な表面構造を研究するために重要です。
* 3Dイメージング： SEMは、電子の集中ビームで表面をスキャンして画像を作成します。この手法により、標本の表面の詳細な3次元画像を作成できます。これは、さまざまな構造の空間的関係を理解するために不可欠です。
* 表面の詳細： SEMは、オブジェクトの表面を研究するように特別に設計されています。試験片の薄いスライスを必要とする透過電子顕微鏡（TEM）とは異なり、SEMはセクションを必要とせずに表面全体を画像化できます。
* 汎用性： SEMは、細胞や組織などの生物学的サンプルから金属や岩などの無機材料まで、広範囲の標本を研究するために使用できます。
TEMや光学顕微鏡などの他の種類の顕微鏡は貴重な情報を提供できますが、SEMは細胞と生物の表面形態を細かく研究するための理想的なツールです。
