1。 酵素:
* ヌクレアーゼ: これらの酵素はDNAを分解します。主なタイプが2つあります。
* dnase: 特にDNAを分解します。
* rnase: RNAを分解しますが、特定の条件下でDNAを切断することもできます。
* プロテアーゼ: これらの酵素はタンパク質を分解し、DNAに結合して分離することを困難にします。
2。 ポリマー:
* 多糖: これらの炭水化物は、DNAをトラップする粘着性のゲルを形成できます。例には、動物細胞のグリコーゲンと植物細胞の澱粉が含まれます。
* タンパク質: 前述のように、タンパク質はDNAに結合し、その抽出を妨げる可能性があります。
* 脂質: 脂肪と油はDNAの沈殿を妨げ、溶液から除去することを困難にすることができます。
3。 その他の細胞成分:
* セルロースとリグニン: これらは植物細胞壁の構造成分であり、DNAの分離を妨げて除去するのが難しい場合があります。
* 二次代謝産物: これらの化合物は、植物や動物によって生成され、DNA抽出を妨げることができます。例には、タンニン、アルカロイド、顔料が含まれます。
* 塩: 高濃度の塩は、DNA沈殿を破壊し、その精製を妨げる可能性があります。
4。 汚染:
* 微生物DNA: 細菌、菌類、またはその他の微生物からのDNAは、サンプルを汚染する可能性があります。
* 環境DNA: 土壌、水、空気などの供給源からのDNAもサンプルを汚染する可能性があります。
これらの課題に対処するために、DNA抽出プロトコルにはしばしば次の手順が含まれます。
* lyse細胞: 細胞膜を開き、DNAを放出する。
* 酵素を不活性化: 熱処理、化学阻害剤、または機械的破壊を通じて。
* 干渉物質を除去: ろ過、降水、またはその他の方法を通じて。
* DNAを精製: エタノール沈殿やカラムクロマトグラフィーなどの技術を使用します。
適切なDNA抽出方法を選択する際には、特定のタイプの細胞と意図したアプリケーションを考慮することが重要です。