* 核： これは、真核細胞のDNAの主要なリポジトリです。染色体に組織された細胞の遺伝物質の大部分が含まれています。
* ミトコンドリア： これらのオルガネラは、核DNAとは別の独自の円形DNA分子を持っています。このミトコンドリアDNA（mtDNA）は、細胞呼吸に関与するタンパク質のいくつかをコードします。
* 葉緑体（植物と藻類）： ミトコンドリアと同様に、葉緑体には、葉緑体DNA（CpDNA）と呼ばれる独自の円形DNA分子もあります。このDNAは、光合成に関与するタンパク質をコードします。
これらはDNAを含む主要なオルガネラですが、以下など、細胞内にDNAを見つけることができる他の例があります。
* プラスミド： これらは、いくつかの細菌に見られる小さくて円形のDNA分子です。
* ウイルス： 一部のウイルスには、DNAとしての遺伝物質が含まれています。
ミトコンドリアや葉緑体などのオルガネラ内のDNAは、核DNAとは異なり、独自の特性と機能を持っていることに注意することが重要です。
