その理由は次のとおりです。
* 初期の地球は遺伝子共有スープでした： 地球上の生命の初期には、環境は大きく異なっていました。生物はより単純で、細胞膜はより透過性がありました。これにより、ドメイン全体で、さまざまな系統間の遺伝物質の自由交換が可能になりました。
* 祖先の線のぼやけ： HGTは、降下を通じて直接関係していない生物間の遺伝物質の移動です。このプロセスは、伝統的な祖先の線を曖昧にし、遺伝子または生物の進化的歴史を追跡することを困難にしています。
* 複雑な進化の歴史： HGTは複雑な進化関係を導入します。ここでは、1つの生物の遺伝子がまったく異なる系統に由来している可能性があります。 これにより、遺伝子配列のみに基づいて生命の木を再構築することが困難になります。
要約する： 垂直遺伝子導入（親から子孫へ）は相続の主要なモードですが、HGTは地球上の生命の初期の進化の重要な要因でした。それは、3つのドメイン（細菌、古細菌、ユーカリヤ）間の進化的関係を理解する努力を大幅に複雑にしています。
