一次構造の理解
タンパク質の主要な構造は、単にアミノ酸の線形配列です。 それは、各ビーズが特定のアミノ酸を表すビーズの弦のようなものです。
表現のための一般的なアイテム
* 文字列上のビーズ: 最も古典的で直感的な表現。各ビーズは、異なるアミノ酸を表すために異なる色または形状です。弦自体は、アミノ酸を結ぶペプチド結合を表します。
* レゴブリック: さまざまな色のレゴレンガが異なるアミノ酸を表す可能性があり、それらを接続してチェーンを構築できます。
* ペーパークリップまたはクリップ: これらは、ペプチド結合を表し、小さな紙またはアミノ酸を表す他の材料を接続する可能性があります。
* チェーンリンク: 各リンクは異なる色であるか、異なるアミノ酸を表すためのマーキングがある場合があります。
* 色付き糸または弦: 弦のビーズと同様に、さまざまな色の糸を使用して各アミノ酸を表し、それらをつなぐことができます。
* 磁気文字: 各文字は異なるアミノ酸を表すことができ、磁石に接続することができます。
重要な考慮事項
* 「ビーズ」の数: タンパク質は非常に長く(数百から数千のアミノ酸)、必要に応じて長い鎖を構築できる材料を選択してください。
* 明確な区別: アミノ酸を表す各アイテムが他のアイテムと簡単に区別できることを確認してください。
* ラベル: 可能であれば、各アイテムにアミノ酸名または3文字のコードを明確にラベル付けします。
例
短いタンパク質シーケンスを表したいとしましょう:グリシン(gly)、アラニン(ALA)、バリン(VAL)、ロイシン(LEU)
* 文字列上のビーズ: 4つの異なる色のビーズ(たとえば、グリーには緑、alaには赤、ヴァルには青、leuには黄色)を使用し、弦で接続します。
* レゴブリック: 異なる色の4つのレゴレンガを使用し(上記の配色に一致)、それらを一緒にスナップします。
覚えておいてください: 重要なのは、タンパク質の一次構造の定義的特性であるアミノ酸の線形配列を正確に反映する視覚表現を作成することです。