ただし、ATPシンターゼは、光合成に間接的に関連しています なぜなら：
* 光合成により、エネルギーキャリアNADPHとATPが生成されます。 これらのエネルギーキャリアは、カルバンサイクルでグルコースを生成するために使用されます。
* グルコースは、細胞呼吸の燃料源です。 これは、呼吸中にATPシンターゼによって生成されるATPが、最終的に光合成によって最初に捕獲されたエネルギーによって最終的に駆動されることを意味します。
これが簡略化された類推です：
* 光合成は、バッテリーを充電するようなものです（ATPとNADPHの生成）。
* 細胞呼吸は、バッテリーを使用するようなものです（グルコースを分解してATPを生成します）
* ATPシンターゼは、バッテリーを使用してセルラープロセスに電源を入れるデバイスです。
したがって、ATPシンターゼ自体は光合成に関与していませんが、機能する光合成（ATPおよびNADPH）の産物に依存しています。
