1。 身体的類似点に焦点を当てます： Linnaeusは、主に観察可能な物理的特性に依存して生物を分類しました。表面的に類似した種をグループ化するのに効果的ですが、このシステムはしばしばより深い進化的関係を見落とし、時には無関係な生物を一緒にグループ化しました。
2。 進化的文脈の欠如： Linnaeusのシステムは、19世紀のダーウィンの仕事まで広く受け入れられていなかった進化の概念を組み込んでいませんでした。 これは、システムには、種が時間とともにどのように変化し、互いに関係がどのように変化するかを理解するためのフレームワークがないことを意味していました。
3。 多様性の限られた理解： Linnaeusの時代には、多くの生物が発見されていませんでした。新種が発見されたため、既存の分類システムはそれらを効果的に収容するのに苦労しました。
4。 いくつかのカテゴリの人工性： Linnaeusのカテゴリのいくつかは、やや任意の機能に基づいています。たとえば、彼は花の雄しべの数に基づいて植物をグループ化しました。
5。 遺伝学と分子生物学の進歩： 20世紀の遺伝学と分子生物学の発達は、科学者に進化関係を研究するための強力な新しいツールを提供しました。 これらのツールにより、生物の遺伝的構成を比較することができ、形態だけで観察されるよりもはるかに深い関係を明らかにしました。
結果の変更：
これらの要因により、科学者は次のような新しい分類システムを開発するようになりました。
* cladistics： 進化的関係を確立するための共有派生特性（Synapomorphies）に焦点を当てる方法。
* 系統学的分類法： 生物の進化的歴史を反映する階層分類を作成しようとするシステム。
* 分子系統学： DNAとタンパク質配列を利用して、進化的関係を再構築します。
Linnaeusのシステムは、自然界の理解に大きく貢献していましたが、最終的には、地球上の生命の多様性と相互接続性をよりよく反映する、より洗練された進化に基づいた分類システムに取って代わられました。
