1。細胞壁の構造:
* 細菌: 硬いペプチドグリカン細胞壁を持っているため、分解するのが難しい場合があります。これには、酵素消化やビーズによる身体的混乱などの特定の方法が必要です。
* 植物: また、細胞壁がありますが、セルロースやその他の多糖類で作られています。これには、洗剤や酵素などの強力な化学処理が必要です。
* 動物: 細胞壁が不足しているため、DNA抽出が比較的容易になります。
2。 DNAの場所:
* 細菌: DNAは、核に囲まれていないヌクレオイド領域にあります。
* 植物: DNAは核に囲まれていますが、葉緑体やミトコンドリアなどのオルガネラにも存在します。
* 動物: DNAは主に核にあります。
3。汚染:
* 植物: DNA抽出および下流の用途を妨げる可能性のある高レベルの多糖類とポリフェノールを含めることができます。
* 動物: RNAで汚染することができます。RNAは、酵素消化によって除去できます。
* 細菌: 下流のアプリケーションに干渉する可能性のあるリポ多糖で汚染される可能性があります。
4。サンプルタイプ:
* 細菌: 液体または固体媒体で培養できるため、大量の細胞を簡単に入手できます。
* 植物: 葉、花、根などのさまざまな組織から入手できます。異なる組織は、さまざまな品質とDNAの量をもたらす可能性があります。
* 動物: 血液、組織、または唾液サンプルから得ることができ、ソースに応じて複雑さが異なります。
5。 全体的なプロセス:
* 細菌: 抽出には、細胞を溶解し、DNAを分離し、細胞の破片から精製することが含まれます。
* 植物: 抽出には、細胞壁を分解し、他の細胞成分からDNAを精製し、汚染物質を除去することが含まれます。
* 動物: 抽出には、細胞を溶解し、DNAをタンパク質や他の細胞成分から分離し、DNAを精製することが含まれます。
具体的な考慮事項:
* 細菌: ペプチドグリカン細胞壁を分解するには、特定の溶解方法が必要です。
* 植物: 多くの場合、RNase処理やポリフェノール除去などの追加の手順が必要です。
* 動物: サンプルは、特殊な採血チューブの使用など、劣化を最小限に抑える方法で収集する必要があります。
全体として、DNAを抽出するプロセスは生物間で根本的に類似していますが、関連する特定の方法とステップは、細胞構造、DNA位置、および潜在的な汚染物質の違いにより大きく異なります。