いくつかのまれな例外がありますが（酵素として作用する可能性のあるリボザイムと呼ばれるいくつかのRNA分子のように）、酵素の大部分はタンパク質です。
その理由は次のとおりです。
* 構造： タンパク質はアミノ酸で構成されており、複雑な3次元構造に折りたたむことができます。この正確な構造は、酵素の機能にとって重要です。
* 特異性： タンパク質は、他の分子との相互作用において非常に特異的です。酵素には、特定の基質に結合する活性部位があり、特定の反応のみを触媒することができます。
* 触媒活性： 酵素の活性部位のアミノ酸は、化学結合の破壊と形成を促進するように配置され、それ自体が消費されることなく反応を加速します。
したがって、他の一部の分子は触媒として作用することができますが、生物学的系の酵素の大部分はタンパク質です。
