要約:
SARS-COV-2ウイルスによって引き起こされる進行中のCovid-19パンデミックは、効果的な治療介入の緊急の必要性を生み出しました。ストレプトマイセスから分離された天然産物であるプラジミシンAは、ウイルスN-グリカンを標的とすることにより、SARS-COV-2を含むさまざまな包囲されたウイルスに対して有望な抗ウイルス活性を示しています。ただし、プラジミシンAがN-グリカンとどのように相互作用し、ウイルス侵入を阻害するかの分子の詳細は不明のままです。 SARS-COV-2 N-グリカンへの結合AのプラジミシンAの分子基盤を調査するために、分子ドッキング、分子動力学シミュレーション、および表面プラズモン共鳴(SPR)実験を実施しました。我々の結果は、プラディミシンAが水素結合、静電相互作用、疎水性接触を介してN-グリカンと安定した複合体を形成することを示唆しています。特に、2,6-ジアミノグルコースと3,4,6-トリヒドロキシフェニルのプラジミシンの部分は、N-グリカンへの結合における重要な役割を果たしています。さらに、SPR実験により、プラジミシンAとN-グリカンの間の直接的な相互作用が確認されました。全体として、私たちの研究は、プラジミシンAの抗ウイルス活性の根底にある分子メカニズムに関する洞察を提供し、新規SARS-COV-2侵入阻害剤の開発のためのリード化合物としてのその可能性を強調しています。