水素イオンポンプはATPを使用して膜を横切って水素イオンを輸送し、細胞プロセスを駆動するプロトン勾配を作成します。これらのポンプには、水素イオンの動きを促進するタンパク質チャネルが含まれています。チャネルは、タンパク質の内部に並ぶいくつかのアミノ酸残基によって形成され、水素イオンの通過のための親水性環境を作り出します。これらの残基には、水素イオンと相互作用できる官能基があり、膜を横切って輸送できるようにします。チャネルの構造により、水素イオンの特異的かつ効率的な輸送が保証され、ポンプがプロトン勾配を維持し、細胞機能をサポートできます。