DNA二重らせんに塩基を組み合わせた結合のタイプは、水素結合と呼ばれます。水素結合は、電気陰性原子と電気陰性原子に結合された水素原子との間に形成される弱い化学結合です。 DNAでは、水素結合は、プリン（アデニンとグアニン）の窒素原子とピリミジンの酸素原子（チミンとシトシン）の間に形成されます。塩基対の水素結合は、二重らせんに2つのDNAを一緒に保持するものです。
