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ATリッチまたはGCリッチDNAの融解温度は高くなっていますか?

GCが豊富なDNAは、豊富なDNAよりも融解温度(TM)が高くなっています。

ここに:

* 水素結合: グアニン(G)とシトシン(C)は互いに3つの水素結合を形成し、アデニン(A)とチミン(T)は2つの水素結合のみを形成します。

* 積み上げ相互作用: DNAスタックの平面ベースは互いに上にあります。 GCペアは、表面積が大きく、疎水性相互作用が強いため、より効率的なスタッキング相互作用を備えています。

* 安定性: GCペアでのより強い水素結合とより好ましい積み重ね相互作用は、DNA分子の全体的な安定性の向上に寄与します。

したがって、GC含有量が高いほど融解温度が高くなります。

実際的な意味:

* pcr: ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)では、GC含有量が高いプライマーがより高いTMを持っているため、反応の特異性と効率を改善できるため、しばしば好まれます。

* DNAハイブリダイゼーション: DNAハイブリダイゼーションに使用されるプローブのGC含有量が多いほど、結合親和性と特異性が向上する可能性があります。

* ゲノミクス: GC含有量が高いゲノムの領域は、多くの場合、遺伝子が豊富な領域に関連しており、転写活性のレベルが高くなっています。

要約すると、GCリッチDNAは豊富なDNAよりも安定しているため、融解温度が高くなります。

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