1。サンプル要件：
* 揮発性化合物に限定： 質量分析は、分解なしで気化できる化合物で最適に機能します。これにより、ポリマーや大きな生体分子などの多くの不揮発性化合物への応用が制限されます。
* サンプル準備： サンプルの準備は時間がかかり、複雑な場合があり、多くの場合、誘導体化または抽出ステップが必要です。
* 小さなサンプルサイズ： この手法は非常に敏感な場合がありますが、多くの場合、サンプルサイズが小さく、容易に入手できない場合があります。
2。複雑さとコスト：
* 高価な計装： 質量分析計は、購入と保守に費用がかかる洗練された楽器です。
* 技術的な専門知識： マススペクトルの運用と解釈には、特別なトレーニングと知識が必要です。
3。特異性の制限：
* 異性体： 異性体（同じ式と同じ構造を持つ分子）は、同一の質量対電荷比を持つことができ、分化は困難になります。
* 断片化パターン： 断片化パターンは複雑であり、慎重な分析と解釈が必要です。
4。イオン化アーチファクトの可能性：
* イオン化プロセス： イオン化プロセスは、分子内にアーティファクトまたは再配置を導入し、観測された質量スペクトルを潜在的に変更する可能性があります。
* マトリックス効果： マトリックス支援レーザー脱着/イオン化（MALDI）および他の技術では、サンプル内の他の化合物の存在はイオン化に影響を与え、スペクトルを複雑にすることができます。
5。環境要因に対する感受性：
* 真空要件： 質量分析計には高い真空条件が必要であり、これは漏れや汚染などの環境要因に敏感です。
* ガス汚染： 機器で使用されるガス内の汚染物質は、分析を妨げる可能性があります。
6。構造に関する限られた情報：
* 限られた構造情報： 質量対電荷比は分子量に関する情報を提供しますが、分子の構造に関する詳細な情報を直接提供しません。
* 補完的な手法の必要性： 質量分析は、多くの場合、NMR分光法やクロマトグラフィーなどの他の手法と組み合わせて、分析物の構造のより完全な絵を獲得します。
全体として、質量分析は多くの利点を持つ貴重なツールですが、特定の分析に適用する前に、その制限と潜在的な欠点を考慮することが重要です。
