極性は複雑です：
* アミノ酸側鎖： アミノ酸配列の極性は、主に側鎖によって決定されます アミノ酸の。一部のサイドチェーンは極性（親水性）ですが、他のサイドチェーンは非極性（疎水性）です。
* 二次構造： アルファヘリックスやベータシートなどの二次構造は、水素結合から生じます。 アミノ酸の骨格原子間。この水素結合は、側鎖自体の極性を直接変化させません。
二次構造が極性にどのように影響するか：
* 疎水性相互作用： 二次構造は、グループ疎水性側鎖を一緒に に役立ちます タンパク質のコア内で、極性鎖を溶媒にさらしながら。これにより、タンパク質表面の全体的な極性が増加する可能性があります。
* 水素結合ネットワーク： 二次構造の水素結合は、新しい極性相互作用を作成することもできます タンパク質内で、全体的な極性に影響を与えます。
キーポイント：
*それは簡単な比較ではありません。 アミノ酸配列と二次構造の両方がタンパク質の全体的な極性に寄与します。
* 二次構造は、極側のサイドチェーンが環境にどのようにさらされるかに影響を与える可能性があります タンパク質の全体的な極性を潜在的に増加させる。
結論として、一方は他方よりも「極性」であると言うことは、単純化しすぎている。どちらの要因もタンパク質の全体的な極性に寄与します。
