鳥の直接的な祖先としての_archaeopteryx_の伝統的な見解に対する主な議論の1つは、現代の鳥の特徴である重要な特徴のいくつかを欠いているという事実です。たとえば、_archaeopteryx_には長い骨の尾がありますが、現代の鳥には短いピゴスチルの尾があります。 _archaeopteryx_には各翼に3本の指がありますが、現代の鳥には2本しかありません。
_archaeopteryx_の伝統的な見解に対する別の議論は、鳥と密接に関連していない小さな肉食性恐竜である_compsognathus_と同じ地質層で発見されたという事実です。これは、_archaeopteryx_が鳥の直接の祖先ではなく、恐竜と一緒に住んでいた可能性があることを示唆しています。
これらの課題にもかかわらず、_archaeopteryx_の体系的な位置は議論の問題のままです。 _archaeopteryx_は恐竜と鳥の間の移行化石であるとまだ信じている科学者もいれば、恐竜の近親者_deinonychus_と_velociraptor_の親relativeであると信じている科学者もいます。この議論を解決するには、さらなる研究が必要です。
