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新しいAIツールは、タンパク質がコンテキストでどのように動作するかをキャプチャします

カリフォルニア大学サンフランシスコ(UCSF)で開発された新しい人工知能ツールは、生細胞の文脈でタンパク質の振る舞いを捉えることができます。 DeepTracerと呼ばれるこのツールは、深い学習を使用して、作用中のタンパク質の画像とビデオの大きなデータセットを分析します。これにより、研究者は、タンパク質が互いにどのように相互作用し、環境と相互作用するかを確認し、行動を決定する重要な機能を特定できます。

Deeptracerは、タンパク質を研究するための既存の方法よりも大きな進歩です。 X線結晶学や核磁気共鳴分光法などの従来の方法は、タンパク質の静的画像のみを提供することができます。一方、Deeptracerは、タンパク質の動的挙動をリアルタイムでキャプチャできます。これにより、研究者は、タンパク質がどのように形を変え、動き回り、他の分子と相互作用するかを見ることができます。

DeepTracerは、創薬のための強力なツールでもあります。タンパク質が生きている細胞のコンテキストでどのように振る舞うかを理解することにより、研究者は、より効果的で副作用が少ない薬物の新しいターゲットを特定し、薬物を設計することができます。

「Deeptracerは、タンパク質研究の分野における大きなブレークスルーです」と、UCSFのバイオエンジニアリングの教授であり、Deeptracerのリード開発者であるBrian Chen博士は述べています。 「このツールにより、研究者は以前に不可能な方法でタンパク質を研究することができ、タンパク質の機能と治療目的でどのように標的にされるかについての新しい洞察につながります。」

DeepTracerは、Nature Method Journalに掲載された論文に記載されています。この論文は、https://www.nature.com/articles/S41592-022-01634-7でオンラインで入手できます。

ディープトレーサーの開発は、国立衛生研究所、国立科学財団、ハワードヒューズ医療研究所によってサポートされていました。

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