胃腸の生理学と粘膜：
a）pHおよび胆汁抵抗：胃の酸性環境と小腸における胆汁の存在は、一部の微生物にとっては厳しい場合があります。特定のラクトバチルスやビフィドバクテリウム種のような酸耐性または胆汁抵抗メカニズムを備えたものは、生き残り、コロニー化することができます。
b）ムチンおよびグリコカリックス層：腸粘膜層は、異物と有害な微生物に対する保護障壁として機能します。一部の微生物には、粘液または上皮細胞表面に付着できるようにする特殊な構造または酵素があります。このアドヒアランスにより、彼らは腸内にコロニーを定着させ、安定した集団を確立することができます。
微生物相互作用：
a）栄養素の競争：微生物は、腸内の栄養素と空間を競います。効率的な栄養の摂取と利用を備えた細菌は、他の人を打ち負かし、支配的になる可能性がありますが、熟練した熟練者は生き残るのに苦労しています。
b）共生および共生関係：多くの腸の微生物は、互いまたは宿主と協力的な関係に従事しています。プロバイオティクスバクテリアは、病原性細菌の成長を阻害しながら、他の共生に利益をもたらす短鎖脂肪酸（SCFA）を産生する可能性があります。
c）クォーラムセンシング：微生物は化学シグナルを介して通信して、その挙動と遺伝子発現を調整します。これにより、栄養習得、免疫応答に対する保護、抗生物質に対する耐性を促進するコミュニティ（バイオフィルム）を形成することができます。
ホスト要因：
a）免疫調節：腸内免疫システムは、有益な微生物と有害な微生物を常に監視し、区別します。バランスの取れた免疫応答により、特定の微生物が病原体を除去しながら持続することができます。免疫系の反応が調節不全になっている場合、微生物のコロニー形成と多様性に影響を与える可能性があります。
b）宿主遺伝学：ヒト遺伝学の変動は腸内微生物組成に影響します。特定の遺伝子と遺伝的多型は、栄養吸収、免疫応答、および腸環境の構造に影響を与え、間接的にどの微生物が繁栄するかに影響を与える可能性があります。
環境要因：
A）食事：食事の選択は、腸内微生物叢の組成に大きく影響します。プレバイオティクス（特定の有益な微生物を供給する非消化不可能な繊維）とプロバイオティクス（健康上の利点を持つ生きた微生物）は、望ましい細菌で腸を豊かにすることができます。
b）抗生物質の使用：抗生物質は、病原性と有益な細菌の両方を排除することにより、腸内微生物バランスを破壊し、日和見的な微生物が定着する機会を生み出します。
要約すると、人間の腸における微生物の生存は、胃腸の状態に対する回復力、多様な腸の生態系内での相互作用と競争、宿主免疫系の調節メカニズム、宿主の遺伝的要因、食事や抗生物質使用などの外部の影響に依存します。これらの複雑な因子は収束して、どの微生物が正常に定着し、腸内で自分自身を確立するかを決定します。
