1。疎水性相互作用 ：これらは、水との接触を最小限に抑えるために水溶液中に凝集する非極性（疎水性）分子または分子の領域の傾向から生じる非共有相互作用です。タンパク質の非水性内部では、アミノ酸の疎水性側鎖が一緒にクラスター化して、水分子を除く安定したコアを形成します。
2。 van der waals力 ：これらは、双極子双極子の相互作用、誘導双極子型相互作用、およびロンドン分散力を含む、弱く非共有相互作用です。ファンデルワールスの力は、疎水性コアに追加の安定化を提供することにより、タンパク質の内部の全体的な安定性とコンパクトさに寄与します。
3。水素結合 ：水素結合もタンパク質の水面でも普及していますが、それらは非水内内でも形成することができます。これらの水素結合は、水分子に直接曝露されていないアミノ酸の極性鎖または帯電した側鎖の間で発生します。
4。ジスルフィド結合 ：ジスルフィド結合は、システイン残基の硫黄原子の間に形成される共有結合です。これらの結合は、サイトゾルの還元環境が酸化化細胞外環境から保護されているタンパク質の内部でより一般的です。ジスルフィド結合は、タンパク質の構造的安定性と剛性に寄与します。
一方、タンパク質の水面は、さまざまな種類の結合によって特徴付けられます。
1。水と水素結合 ：タンパク質の表面上のアミノ酸の極および荷電サイドチェーンは、水分子と水素結合を形成し、水性環境でのタンパク質の水分補給と溶解度に寄与します。
2。イオン結合 ：これらは、タンパク質の表面上の正と負に帯電したグループと、周囲の水溶液中の反対に帯電したイオンとの間の静電的相互作用です。イオン結合は、タンパク質の全体的な電荷と他の分子との相互作用を維持する上で重要な役割を果たします。
3。極性相互作用 ：水性環境では、アミノ酸と水分子または他の極性分子の極側鎖の間に、双極子双極子相互作用や双極子誘導双極子相互作用などの極性相互作用が発生します。
