原核生物および真核細胞におけるミトコンドリアの内膜によって形成される個々の嚢は、クリステと呼ばれます。これらは、ミトコンドリアマトリックスに投影する棚のような構造です。クリスタは内膜の表面積を増加させます。これは、細胞呼吸に不可欠です。ミトコンドリアマトリックスは、内側のミトコンドリア膜に囲まれた空間です。ミトコンドリアDNA（mtDNA）、リボソーム、酵素、およびミトコンドリア機能に必要な他の分子が含まれています。