* 高解像度： TEMは、利用可能な最高の解像度イメージングを提供し、科学者がナノメートルスケールで構造を視覚化できるようにします。これは、タンパク質分子の複雑な詳細を研究するために不可欠です。
* 薄いサンプル： TEMは、電子が通過できるようにするために、薄いサンプル（通常はスライスまたは特別に準備された）が必要です。これは、細胞表面の研究に適しています。
* 内部構造： TEMは、細胞膜上のタンパク質の配置を含む細胞の内部構造を明らかにすることができます。
* 電子密度： TEMは、電子とサンプルとの相互作用を利用して、さまざまな電子密度の領域を強調表示します。これは、タンパク質分子を他の細胞成分と区別するのに役立ちます。
他のツールはTEMと組み合わせて使用される場合がありますが、細胞表面上のタンパク質分子の詳細な研究の主な選択肢です。
この研究で使用される可能性のある他のツールは次のとおりですが、主要なツールとしてではありません。
* 走査型電子顕微鏡（SEM）： SEMは3D表面ビューを提供しますが、TEMよりも低い解像度を提供します。細胞表面の特徴を視覚化するのに役立ちますが、タンパク質構造の細かい詳細ではありません。
* 原子間顕微鏡（AFM）： AFMは、細胞の表面や個々のタンパク質を画像化するために使用できます。 SEMよりも高い解像度を提供しますが、TEMほど高くはありません。
* X線結晶学： この手法は、原子分解能でタンパク質の3D構造を決定するために使用できますが、タンパク質の純粋なサンプルが必要です。
最終的に、最良のツールは、特定の研究の質問と望ましいレベルの詳細に依存します。
