1。認識シーケンス:
* 特異性: 各制限酵素は、DNAヌクレオチドの特定の短い配列を認識します。このシーケンスは通常、長さ4〜8個の塩基ペアであり、認識シーケンスと呼ばれます。 または制限サイト 。
* パリンドロミック性: 多くの認識シーケンスはパリンドロミックです。つまり、反対側のDNA鎖で同じ後方と前方を読みます。たとえば、酵素ECORIはシーケンスGAATTCを認識します。これは、相補鎖(CTTAAG)で右から左に読む場合も同じです。
2。切断:
* 切断: 制限酵素が認識シーケンスを見つけると、その配列内の特定のポイントでDNA分子を削減します。
* スティッキーエンドとブラントエンド: 制限酵素カットが「粘着性の端」または「鈍い端」のいずれかを生成する方法。
* 粘着端: 酵素はDNA鎖を異なる位置で切断し、同じ酵素で切断した他のDNA分子からの相補的なオーバーハングとベースペアをベースペアにすることができる短い一本鎖オーバーハングを残します。これは、組換えDNA分子の作成に役立ちます。
* 鈍い終了: 酵素は両方のDNAの鎖を同じ位置に切り、オーバーハングを残しません。
要約:
次の要因により、制限酵素がDNAをどのように削減するかが決定されます。
* 酵素の特定の認識シーケンス
* DNA分子内のその配列の位置。
* 酵素の特定の切断パターン(粘着端と鈍い端)。
例:
酵素ECORIはシーケンスGAATTCでDNAを切断し、粘着性の端を生成します。これは、その配列を含む任意のDNA分子を切断することを意味し、結果として得られるDNAフラグメントには、クローニングまたは他の遺伝子操作に使用できる一本鎖オーバーハングがあります。