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遺伝子のORFは何ですか?

オープンリーディングフレーム(ORF)

オープンリーディングフレーム(ORF)は、タンパク質に変換できるDNAまたはRNAのシーケンスです。特徴付けられます:

1。コドンを開始: ORFは、通常AUG(メチオニン)、スタートコドンから始まります。

2。停止コドン: ORFは、通常はUAA、UAG、またはUGA、停止コドンで終わります。

3。連続コーディングシーケンス: 開始コドンと停止コドンの間のシーケンスは、タンパク質に翻訳できる連続的なコドンです。

4。読み取りフレーム: ORFは特定の読み取りフレームで読み取られます。つまり、コドンは3つのヌクレオチドのセットにグループ化されています。

ORFSの重要性:

* タンパク質合成: ORFは、タンパク質合成に必要な遺伝情報を提供します。

* 遺伝子識別: ORFを識別することは、遺伝子予測と注釈の重要なステップです。

* 機能分析: ORFの分析は、遺伝子の機能を決定するのに役立ちます。

* 進化研究: ORFは、生物間の進化的関係を理解する上で役割を果たします。

ORFSの検索:

ORFは通常、次の機能を検索するバイオインフォマティックツールを使用して識別されます。

* コドンを開始および停止

* コーディングシーケンス長

* 既知の遺伝子とのシーケンス相同性

例:

`` `

... atggtgcaaggttacgtgtgtag ...

`` `

このシーケンスでは、ORFは次のとおりです。

* codonを開始: 8月

* 停止コドン: uag

* コーディングシーケンス: atggtgcaaggttacgtgt

注:

*すべてのORFがタンパク質に翻訳されているわけではありません。一部のORFは非コードである場合があるか、タンパク質非タンパク質コードRNAにエンコードする場合があります。

* ORFの長さと配列は、遺伝子間で大きく異なる場合があります。

* ORFの概念は、遺伝子発現とタンパク質機能を理解するために不可欠です。

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