重要な違い：
|機能|原核剤|プロトクスト（プロトイスト）|
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| 細胞核 |不在（細胞質のDNA）|現在（核のDNA）|
| オルガネラ |膜結合オルガネラがほとんどまたはまったくない|多くの膜結合オルガネラ|
| サイズ |通常、小さい（1〜10マイクロメートル）|多くの場合、大きい（10〜100マイクロメートル）|
| 複雑さ |よりシンプルな細胞構造|より複雑な細胞構造|
| 複製 |バイナリ核分裂|無性および性的生殖|
| 例 |細菌、古細菌|藻類、アメーバ、スライム型|
一言で言えば：
* 原核生物はより単純です： それらは核や他の膜結合オルガネラを欠いています。それらはより単純な内部構造を持っています。
* プロトクティストはより複雑です： それらには核があり、彼らの細胞はより複雑な内部構造で組織されています。
重要なメモ：
* 例外： これらのルールのいくつかには例外がありますが、それらは一般的に良いガイドラインです。
* 顕微鏡： 原核生物とプロトクストの両方が微視的な生物です。これは、それらを観察するために顕微鏡が必要なことを意味します。
顕微鏡の使用：
* 核： 顕微鏡下での最も明らかな違いは、プロトクストの核の存在です。原核生物は異なる核を欠いています。
* オルガネラ： プロトクストは、葉緑体（光合成用）やミトコンドリア（エネルギー生産用）などのより精巧な内部構造をしばしば示します。
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