クエン酸サイクル中に、2つの炭素原子が二酸化炭素(CO2)として除去されました。これは、細胞呼吸の廃棄物です。クエン酸サイクルに入る各アセチルCOAは、2つの炭素原子を運びます。サイクルの1つの革命の間、CO2の2つの分子が解放されます。それらは、アセチルCOAに入った炭素原子と、元々クエン酸分子の他の成分の一部であった炭素原子を運びます。