DNA損傷のタイプ： 異なるDNA損傷修復経路は、特定のタイプのDNA損傷の処理に特化しています。たとえば、塩基切除修復（BER）は、酸化塩基や一本鎖切断などの小型ではないDNA病変の修復を担当します。一方、相同組換え（HR）および非相対末端結合（NHEJ）は、より複雑で潜在的に致命的なDNA病変である二本鎖切断（DSB）の修復に関与しています。
細胞周期段階： 細胞周期の段階は、DNA損傷修復経路の選択にも影響します。一般に、HRは、正確な修復のためのテンプレートとして姉妹染色分体が利用可能な細胞周期のSおよびG2相中の主要なDSB修復経路です。ただし、NHEJは細胞を含む細胞を含め、細胞周期全体で動作できます。
修復タンパク質の可用性： 特定の修復タンパク質の可用性と活性は、DNA損傷修復経路の選択を決定する上で重要な役割を果たします。たとえば、HRにはBrca2およびRad51タンパク質の存在が不可欠ですが、Ku70およびKu80タンパク質はNHEJに必要です。特定の経路の重要なタンパク質が不足または変異している場合、細胞は代替の修復経路に依存しているか、エラーが発生しやすい修復メカニズムを受ける可能性があります。
DNA損傷シグナル伝達経路： DNA損傷は、DNA修復を含む細胞応答を調整するさまざまなシグナル伝達経路の活性化を引き起こします。 ATM（運動失調症 - テランギオエクタジアが変異）やATR（運動失調症と系統ectasiaおよびRad3関連）経路などのこれらの経路は、修復タンパク質を損傷部位に補充し、特定の修復経路の選択を促進するのに役立ちます。
細胞のコンテキストとエピジェネティックな修正： 細胞のコンテキストとエピジェネティックな修正は、DNA損傷修復経路の選択にも影響を与える可能性があります。たとえば、特定のタイプのDNA損傷は、特定の細胞タイプまたは組織でより一般的である可能性があり、特定の修復経路の優先的な使用につながります。 DNAメチル化やヒストン修飾などのエピジェネティックな修飾は、クロマチンの構造とアクセシビリティに影響を与える可能性があり、それによってDNA修復経路の効率と選択に影響を与えます。
要約すると、細胞は、DNA損傷の種類、細胞周期段階、修復タンパク質の利用可能性、DNA損傷シグナル伝達経路、および細胞の文脈に基づいて、DNA損傷修復経路を選択します。適切な修復経路の選択は、ゲノムの安定性を維持し、突然変異を防ぎ、適切な細胞機能を確保するために重要です。
