その理由は次のとおりです。
* 小さなリボソーム： ミトコンドリアと葉緑体の両方に独自のリボソームがあり、真核細胞の細胞質に見られるリボソームよりも小さい。これは、それらのリボソームが原核細胞に見られるリボソームよりも類似しているためです。
* 円形DNA： ミトコンドリアと葉緑体の両方に、それぞれミトコンドリアDNA（mtDNA）と葉緑体DNA（CpDNA）と呼ばれる独自の円形DNA分子があります。これは、循環DNAもある原核生物との別の類似性です。
原核生物とのこの類似性は、内共生理論を支持する重要な証拠の1つです 、ミトコンドリアと葉緑体は、初期の真核細胞に包まれた自由生活細菌に由来することを提案しています。時間が経つにつれて、これらの細菌は真核細胞に統合され、今日見られるオルガネラに進化しました。
