ドメイン：
* サイズ： 通常、40〜200アミノ酸で構成されるモチーフよりも大きくなります。
* 構造： タンパク質内の独立した折り畳まれたユニット、しばしば明確な3次元形状を備えています。
* 関数： DNAへの結合、他のタンパク質との相互作用、酵素反応の触媒などの特定の機能を実行できます。
* 発生： 多くの場合、順番に変動しますが、同様の構造と機能を維持することが多い複数のタンパク質で発生する可能性があります。
* 例： リン酸化されたチロシン残基に結合するSH2ドメインは、多くのシグナル伝達タンパク質に見られます。
モチーフ：
* サイズ： ドメインよりも小さく、通常は3〜10個のアミノ酸で構成されています。
* 構造： タンパク質内のアミノ酸の短い、再発パターン。それらは独立して折りたたまれていないかもしれませんが、ドメインの全体的な構造と機能に貢献します。
* 関数： リガンドへの結合や他のモチーフとの相互作用など、ドメイン内の特定の機能に貢献します。
* 発生： ドメイン内で、多くの場合、同じまたは異なるタンパク質の複数のドメインで見つけることができます。
* 例： ヘリックスターンヘリックスモチーフは、多くのDNA結合タンパク質に含まれており、DNA二重ヘリックスとの相互作用を促進します。
要約：
* ドメインは、特定の機能を実行するより大きく独立した折りたたみユニットですが、モチーフはドメインの機能に寄与する繰り返しのパターンが小さくなります。
* ドメインは複数のモチーフで構成できますが、モチーフは独立してドメインを形成することはできません。
* ドメインとモチーフの両方がタンパク質の構造と機能に不可欠です。
これが類推です：タンパク質を家と考えてください。ドメインは、特定の機能（キッチン、ベッドルーム、バスルームなど）を備えた個々の部屋のようなものです。モチーフは、窓、ドア、暖炉など、部屋内の特定の建築的特徴のようなもので、部屋の全体的な機能に貢献しています。
