分子原子の色 – CPK 色

私たちは皆、分子のモデルを見てきました。化学部門には、原子と分子内での配置を表すためにくっつけられるプラスチック ボールのキットがよくあります。これらのキットには、要素を簡単に区別できるように、いくつかの異なる色が用意されています。各原子の色の選択は任意ではありません。 CPK カラーとして知られている要素に色を一致させる規則があります。

CPK の部分は、最初に色を使用して要素を一致させた科学者のイニシャルに由来します。コーリー、ポーリング、コルタン。 1952 年、Robert Corey と Linus Pauling はモデルに基本的なカラー コードを使用しました。

カーボンブラック
水素 – 白
窒素 – ライトブルー
酸素 – 赤

この配色は、基本的な有機化学分子の大多数の原子をカバーしていますが、明らかにそれらすべてではありません. Walter Koltun は、1962 年に分子セットの特許を申請し、カラー リストをより多くの要素に拡張しました。

コルトゥンのリストが含まれています

カーボンブラック
水素 – 白
窒素 – 青
酸素 – 赤
硫黄 – 黄色
リン – 紫
ハロゲン – 緑 – フッ素の明るい緑から始まり、グループを下るにつれて暗くなります
金属 – シルバーまたはグレー

CPK の配色には決まった標準はありませんが、ほぼすべての分子キットが同じ共通の CPK カラーを使用しています。これらの色は通常、要素のプロパティに関連付けられた色です。硫黄は黄色、炭素は黒、塩素ガスは緑、ヨウ素ガスは紫です。他のものはそれほど明白ではありません。窒素は空にあり、空は青いので、窒素原子は青いです。酸素は血液に含まれています。血液は赤いため、酸素原子は赤く着色されています。

一般的な CPK カラーリング チャート

今日、コンピューターは分子の視覚化を簡単に生成できます。コンピューターは、使用可能な色によって制限されません。必要に応じて、すべての要素に異なる色を割り当てることができます。現在使用されている最も一般的なソフトウェア分子可視化ソフトウェア パッケージの 1 つは、Jmol と呼ばれます。

Jmol は、分子内で見つかる可能性が高いほぼすべての元素、さらにはいくつかの一般的な同位体に色を割り当てています。これらの同位体には、水素の重水素と三重水素、炭素 13 と炭素 14 と窒素 15 が含まれます。

これらの色とその RGB および 16 進数値を示す JMOL CPK 色周期表の PDF をダウンロードするか、以下の表をお読みください。

CPK カラー ソース:

Corey と Pauling の元のモデルの説明
アミノ酸、ペプチド、タンパク質の分子モデル
ロバート B. コーリー そして ライナス・ポーリング
科学機器のレビュー 24:8, 621-627

Walter Koltun の米国特許
分子モデルの空間充填原子単位とコネクタ

Jmolの色
http://jmol.sourceforge.net/jscolors/