陽子と電子以外にマグネシウム原子を構成する他の亜原子粒子は中性子です。陽子は積極的に帯電し、電子は負に帯電し、中性子には電荷がありません。マグネシウム原子の核には12個のプロトンと12個の中性子が含まれ、電子雲には12個の電子が含まれます。原子の陽子の数は、それがどの要素であるかを決定するため、すべてのマグネシウム原子が12個のプロトンを持っています。ただし、中性子の数は異なる場合があり、同じ元素の異なる同位体が生じます。マグネシウムには、マグネシウム-24、マグネシウム25、マグネシウム26の3つの安定性同位体があります。マグネシウムの3つの同位体は、それぞれ12、13、および14の中性子を持っています。