1。近接性と向き： 酵素は反応物を正しい方向にまとめて、反応を促進します。これにより、システムのエントロピーが減少し、反応がより有利になります。
2。ひずみまたは歪み： 酵素は、その形状を歪める方法で基質を結合し、より反応的にすることができます。これは、遷移状態に近い立体構造の結合基板によってしばしば達成されます。
3。静電相互作用： 酵素は、荷電アミノ酸または補因子を使用して遷移状態を安定させ、そのエネルギーを低下させることができます。これは、帯電した中間体を含む反応にとって特に重要です。
4。酸塩基触媒： 酵素は、アミノ酸残基を使用して陽子を寄付または受け入れ、遷移状態の形成を促進できます。これは、陽子移動を含む反応にとって非常に重要です。
その他の重要なメカニズム：
* 金属イオン触媒： 一部の酵素は金属イオンを使用して、荷電中間体を安定させたり、酸化還元反応を促進したりします。
* 共有触媒： 酵素は、基質と一時的な共有結合を形成して反応性を変化させることができます。
これらのメカニズムは、しばしば複雑な相互作用で協力して望ましい触媒効果を達成することを覚えておくことが重要です。特定のメカニズムは、触媒される個々の酵素と反応に依存します。
