主な違い B DNA と Z DNA の違いは、B-DNA が右利きであるのに対し、Z-DNA は左利きであることです。 さらに、B-DNA では、コアを占める塩基と糖リン酸骨格がヘリックスの周辺に存在しますが、Z-DNA では、糖リン酸骨格がジグザグ パターンを形成します。したがって、ベースは周辺だけでなくコアにも発生します。
B-DNA と Z-DNA は、自然界に存在する DNA の 3 つのコンフォメーションのうちの 2 つです。さらに、B-DNA の直径は 20 Å で、1 ターンあたり 10 残基を含みますが、Z-DNA の直径は 18 Å で、1 ターンあたり 12 残基を含みます。
対象となる主な分野
1. B DNA とは
– 定義、構造、重要性
2. Z DNA とは
– 定義、構造、重要性
3. B DNA と Z DNA の類似点は何ですか
– 共通機能の概要
4. B DNA と Z DNA の違いは何ですか
– 主な相違点の比較
主な用語
B DNA、DNA のコンフォメーション、直径、ヘリックス ピッチ、ヘリックス センス、Z DNA
B DNAとは
B-DNA は、細胞内の DNA の最も一般的で優勢な構造です。これは、DNA が pH や塩濃度などの自然な生理学的条件下で B 型で存在することを好むことを意味します。さらに、DNAのB型はジェームズ・ワトソンとフランシス・クリックによって最初に記述されましたが、B-DNAは変化する条件下で他のコンフォメーションをとります。
図 1:A、B、および Z-DNA の構造
さらに、B-DNA の主な特徴には、右巻き、34 Å ピッチ、1 ターンあたり 10 反復単位、 モノヌクレオチド反復単位、20 Å のらせん直径が含まれます。など
Z DNA とは
Z-DNA は、左巻きのらせん構造とジグザグ パターンを形成する糖-リン酸骨格を持つ DNA の別のコンフォメーションです。さらに、Andrew Wang と Alexander Rich によって最初に記述されました。 Z-DNA は高塩濃度に反応して形成されます。 Z-DNA は、DNA を不活性に保つことができるため、遺伝子発現の調節に役割を果たします。
図 2:A、B、および Z-DNA のヘリックス軸
さらに、Z-DNA の重要な特徴には、45 Å ピッチ、1 ターンあたり 6 繰り返し単位、 ジヌクレオチド繰り返し単位、18 Å のらせん直径などがあります。
B DNA と Z DNA の類似点
- B-DNA と Z-DNA は自然界に見られる DNA の 3 つのコンフォメーションのうちの 2 つ。
- 両方のタイプの DNA には、二重の鎖状のらせん構造。
- さらに、両方のストランドは逆平行です。
- 糖に結合したヌクレオチド塩基を含む-リン酸骨格。
- アデニンはチミンと 2 つの水素結合を形成しますが、シトシンは、両方の形態の DNA でグアニンと 3 つの水素結合 を形成します。
- 両方のタイプの DNA が生体内で発生する可能性がありますさまざまな生物学的条件下で。
B DNA と Z DNA の違い
定義
B-DNA は、二重らせん DNA の典型的な形を指し、らせんの軸の前部で鎖が右にねじれています。しかし、Z-DNA は二重らせん DNA の左利きの珍しい形を指し、らせんの軸の前部の周りで鎖が上向きに左にねじれます。また、各ヘリカル ターンには 12 塩基対があり、外面には 1 つの溝があります。
フォーメーション
さらに、通常の生理学的条件下では B-DNA が形成され、高塩濃度下では Z-DNA が形成されます。
ヘリックスセンス
B-DNA は右利きですが、Z-DNA は左利きです。したがって、これが B-DNA と Z-DNA の主な違いです。
主溝と副溝
さらに、B-DNAには広くて深い主溝と狭くて深い副溝があり、Z-DNAには狭くて深い主溝と広くて浅い副溝があります。 .
ベースとバックボーン
B-DNA では、塩基がコアを占め、糖-リン酸骨格がらせんの周辺に存在しますが、Z-DNA では、糖-リン酸骨格がジグ-ジグザグパターンであるため、ベースは周辺だけでなくコアにも発生します。
糖残基の向き
また、B-DNA と Z-DNA のもう 1 つの違いは、糖残基の向きです。 B-DNA の糖残基は向きが変化していますが、Z-DNA の糖残基は変化していません。
繰り返しユニット
B-DNA の繰り返し単位はモノヌクレオチドですが、Z-DNA の繰り返し単位はジヌクレオチドです。
ターンごとの残余
B-DNA は 1 ターンあたり 10 残基を含み、Z-DNA は 1 ターンあたり 12 残基を含みます。
繰り返し単位あたりのツイスト角度
さらに、B-DNA の繰り返し単位あたりのねじれ角は 36°ですが、Z-DNA の繰り返し単位あたりのねじれ角は 60°です。
残基あたりの上昇
B-DNA の残基あたりの上昇は 3.4 Å ですが、Z-DNA の残基あたりの上昇は 3.75 Åです。
らせんピッチ
らせんピッチも B-DNA と Z-DNA の違いです。 B-DNA のヘリックス ピッチは 34 Å で、Z-DNA のヘリックス ピッチは 45 Å です。
塩基対の傾き
B-DNA の塩基対の傾きは 6°ですが、Z-DNA の塩基対の傾きは 7°です。
繰り返しユニットのローテーション
さらに、B-DNA の繰り返し単位の回転は 36°、Z-DNA の繰り返し単位の回転は 60°です。
直径
B-DNA の直径は 20 Å で、Z-DNA の直径は 18 Åです。
グリコシドねじれ角
グリコシドのねじれ角は逆です B-DNAのデオキシグアノシンとデオキシシチジンの場合、グリコシドねじれ角はsynです デオキシグアノシンおよびアンチ用 Z-DNAのデオキシシチジン用。
シュガーパッカー
さらに、シュガー パッカーは、B-DNA のデオキシグアノシンの C2' エンドとデオキシシチジンの C3' エンドであり、シュガー パッカーはデオキシグアノシンの C3' エンドと C2' エンドです。 Z-DNAのデオキシシチジン。
軸からの P の距離
軸からの P の距離は、B-DNA の dGpC と dCpG の両方で 9.0 Å であり、軸からの P の距離は dGpC で 8.0 Å、dCpG で 6.9 Å です。 Z-DNAで。
結論
B-DNA は、細胞内に存在する DNA の一般的な形態です。それは右利きであり、コアの塩基と周辺構造の糖リン酸骨格で構成されています。さらに、1 ターンあたり 10 ヌクレオチドが含まれています。 DNA ヘリックスの幅は 20 Å です。一方、Z-DNA は左利きであまり一般的ではない形態の DNA であり、高塩濃度で発生します。さらに、その糖リン酸骨格はジグザグパターンを示します。また、1 ターンあたり 6 つのジヌクレオチドも含まれています。さらに、Z-DNA の幅は 18 Å です。したがって、B-DNA と Z-DNA の主な違いは、らせん構造、形状、および寸法です。
参考文献:
1.「Z-DNA、左利きの DNA フォーム」。 バイオサイクロペディア 、ここから入手できます。
画像提供:
1. Mauroesguerroto 著「Dnaconformations」 – Commons Wikimedia による自身の作品 (CC BY-SA 4.0)
2. 「B&Z&A DNA フォーミュラ」英語版ウィキペディアの Lankenau 著 – en.wikipedia から Commons に転送。 (パブリック ドメイン) Commons Wikimedia 経由
