光合成では、光システムのクロロフィル分子によって光エネルギーが吸収されます。このエネルギーは、これらのクロロフィル分子から電子を励起するために使用され、その後、一次電子受容体に伝達されます。これらの一次電子受容体は通常、キノールに縮小されています。還元されたキノールは、電子を電子輸送鎖に寄付することができます。電子輸送鎖は、電子流のエネルギーを使用して膜を横切って陽子をポンピングする一連の膜結合タンパク質です。これにより、セルのエネルギー通貨であるATPを生成するために使用されるプロトン勾配が作成されます。