その理由は次のとおりです。
* ダルトンの理論は比率に基づいていました： 彼は、要素が質量（明確な比率の法則）によって固定比で組み合わされていることを理解していましたが、原子を直接カウントすることはできませんでした。
* 限られた実験方法： ダルトンは、化学分析と反応の観察に依存していました。彼は個々の原子を見たり数えたりすることができませんでした。
* 分子の概念は進化していました： ダルトンは原子を提案していましたが、分子の概念（2つ以上の原子が結合した）はまだ発達していました。
後の科学者は、ダルトンの研究に基づいて構築され、分子組成を決定する技術の開発につながります：
* Avogadroの法則： 1811年にAmedeo Avogadroによって提案されたこの法律は、同じ温度と圧力の等量のガスが同じ数の分子を含むと述べました。これにより、ガスの量を分子の数に関連付ける方法が提供されました。
* 分光法： 赤外線や質量分析などの技術により、科学者は分子の構造と組成を分析することができました。
* X線結晶学： Max von Laueが先駆けたこの方法により、科学者は結晶内の原子の配置を決定し、分子構造に関する情報を提供することができました。
要約すると、ダルトンは原子理論の基礎を築きましたが、分子内の原子の正確な数を決定することは、はるかに後に、高度な実験方法の開発と分子概念の理解が得られました。
